При частом обновлении RT индексов в Sphinx'e, файлы бинарного лога могут разрастаться в размере:

du -sh /var/data
644M	/var/data/

# Размер всех файлов бинлога

Это снижает скорость восстановления при аварийном перезапуске поисковика. Для того, чтобы удалить лишние данные из логов, можно выполнить сброс индексов:

FLUSH RTINDEX documents;

# Удалит неактуальные бинлоги индекса documents

После этого размер логов значительно уменьшится:

du -sh /var/data
132M	/var/data/

Не стоит выполнять этот запрос вручную постоянно. Для этого в sphinx.conf предусмотрен параметр:

searchd
{
    ...   
    rt_flush_period = 3600
}

# период сброса индексов на диск

Этот параметр задает период в секундах. Каждую итерацию Sphinx будет делать проверку индекса и принимать решение о сбросе. Т.е. операция сброса будет выполняться не всегда, а только когда это необходимо.