Чтобы создать индекс в Mysql, необходимо выполнить запрос:
CREATE INDEX index_name ON table(column1, column2, ...)
Например создадим индекс по одной колонке:
CREATE INDEX email ON users(email)
# Колонка email в таблице users теперь проиндексирована
Читайте также зачем нужны индексы и как они работают.